Словосочетание "в течение" может быть либо существительным с предлогом, либо наречием.
Отличить наречие от существительного легче всего, если попытаться его разделить. Между существительным и предлогом легко подставить зависимое слово (например, "в быстром течении времени" или "в прохладном течении реки"). Наречие же является неделимым (например, "в течение утра").

Усвойте следующее: в современном русском языке, особенно в его деловом стиле, чаще встречается словосочетание "в течение" в качестве наречия. Существительное с предлогом вы можете встретить, в основном, в книжном языке.